La República Checa ingresó a la OTAN en el año 1999. Desde esa fecha es un miembro activo de la organización. Los militares checos han participado en varios entranemientos conjuntos de la OTAN, los batallones de fuerzas especiales y de la unidad química han sido evaluados como unos de los mejores la la alianza.

A finales del año 2002 se efectuó en la capital checa, Praga, la conferencia de la OTAN.