Colombia no figura entre los países prioritarios para la cooperación de desarrollo en la próxima época. Por lo tanto, la cooperación futura con el país se considera sólo a través de la realización de tal llamados pequeños proyectos locales.

En la actualidad la República Checa realizará en Colombia un proyecto de desarrollo de la reforestación del Parque Nacional Chicamocha. La realización se efectuará en cooperación con el Consulado Honorario de la República Checa, el gobierno regional y las universidades locales. El objetivo del proyecto es explorar el ambiente del parque y determinar las plantas más adecuadas para la reforestación. Este proyecto probablemente llevará a otra cooperación mutua.

En el año 2008 se efectuó un proyecto del abastecimiento tecnológico de los centros cardiovasculares de los hospitales en Bogotá y Cartagena de Indias que, entre otras cosas, acogen a las víctimas del conflicto armado en Colombia. En el año 2005 se realizó otro proyecto de desarrollo de la reforestación en Colombia organizado por el Ministerio de Agricultura de la República Checa.

La República Checa también concede becas universitarias a Colombia. Para el año lectivo de 2011/2012 se trató de dos becas para el programa de posgrado en inglés y una beca del programa de máster en checo.

El programa de la cooperación al desarrollo de la UE para Colombia entre los años 2007 y 2013 cuenta con el monto de 160 millones de euros de lo cual 82,4 milllones de euros están designados a cuatro proyectos particulares. Se trata de los siguientes proyectos: “Desarrollo de nuevas áreas de la paz“, “Apoyo al sistema de la jurisdicción penal“, “Fortalecimiento de las acciones del Estado contra las minas antipersonas“ y “Apoyo a la política del Estado en el tema de la protección de los derechos de los fugitivos“.