Národní knihovna v Kosovu byla založena v roce 1944. Zpočátku sídlila v Prizrenu, tehdejším hlavním městě Kosova, později byla přemístěna do Prištiny. V průběhu války v letech 1998-1999 byla velmi poškozena , když prostory knihovny byly zaplaveny. Po válce byla knihovna postupně rekonstruována. Knihovna dostala nové jméno – z Univerzitní knihovny byla přejmenována na Národní knihovnu Pjetëra Bogdaniho. Pjëter Bogdani byl v 17. století katolickým biskupem ve Škodře (severní Albánie) a Skopje (dnes hlavní město FYROM), do jehož působnosti spadalo Kosovo. Mnich a spisovatel Bogdani je pro Albánce jednou z nejrespektovanějších historických osobností díky svému boji proti turecké nadvládě. Zemřel v Prištině na konci 17. století.

Nejvýznamnější podpory při rekonstrukci budov, digitalizaci a získávání nových knih se Národní knihovně dostalo od ambasády USA v Prištině. V roce 2012 Česká republika prostřednictvím své ambasády v Prištině založila v knihovně koutek pro nevidomé a zrakově postižené a vybavila jej IT technologiemi.