Заступником голови уряду був призначений відомий економіст та прибічник економічних реформ Ота Шік, який усвідомлював усе більшу відсталість країни в порівнянні з технологічним рівнем розвитку на Заході.  Уже в першій половині 60-х років разом з командою співробітників він підготував план економічної реформи, відповідно до якої успіх окремих підприємств залежав би від попиту споживачів. Держава мала задати лише основні тенденції розвитку, а підприємства мали діяти в рамках цих тенденцій. У такий спосіб успіх підприємства не залежав би лише від виконання встановленого плану для виробництва продукції, але й від успішного продажу цієї продукції на внутрішньому та закордонному ринку. Так він спробував об’єднати державну та приватну економіку. Уряд і парламент, головою якого було обрано Йозефа Смрковського, звільнялися від влади комуністичної партії. З іншого боку, протягом усього періоду «Празької весни» на вищих  партійних посадах перебувала низка консервативних та промосковськи зорієнтованих політиків, які відкрито виступали проти реформ (Алоіс Індра, Васіл Біляк, Драгомір Колдер та інші).